西方经济学的整个理论体系在科学性上存在不少问题。
第一，西方经济学的理论体系尚未通过实践的检验，因此西方学者目前还只是把西方经济学的理论体系称为“共同认可的理论结构”或“模式”。
第二，西方经济学还缺乏科学应有的内部一致性，在理论体系中同时存在两种或两种以上相互抵触的说法。
第三，西方经济学在发展演变中所取得的成果缺乏积累性，新理论往往完全排斥旧学说，新旧学说之间不是相互补充而是相互排斥。
第四，西方经济学理论体系的假设条件常常是异常苛刻的，往往难以应用于现实生活。
第五，一些西方学者自己也承认，西方经济学不完全是科学。
当然，说西方经济学并不完全是科学，并不是全盘否定它。