从整体来讲，卫生统计信息系统可以为卫生事业宏观管理和科学决策提供信息、咨询、监督和评价。但其具体作用可以归纳为以下几个方面：
（1）、为制定规划提供依据。卫生规划主要是针对当前区域内面临的主要卫生问题提出来的，要回答这些问题均需要大量的数据和信息。
（2）、通过信息反馈，对规划本身和实施进行评价，从而对规划实施进行调控，对规划进行调整。没有一个规划在它执行的初期是十全十美的，其一方面可能是因为获得的信息不准或不全使规划有一定的缺陷，另一方面也可能是因为在规划执行过程中某些因素发生了变化，从而引起规划所处环境发生变化而影响规划的实施。因此在规划的执行过程中，必须通过不断的信息收集和反馈，补充和完善已掌握的信息，同时及时了解规划所处的环境因素的变化及其对规划实施的影响，以及时调整规划，避免规划脱离已变化了的客观实际。（3）、评价规划的效果。在一个规划执行期末，为了解该规划总体目标的实现情况，需要大量的信息对规划执行结果进行评估与判断。