1.跟单信用证主要用于贸易货款的结算；而银行保函的应用范围要大得多，既可用作货款结算工具，又可用于其他各种信用担保。
2.跟单信用证一概独立于贸易合同；而银行保函却未必独立于基础合约。
3.跟单信用证的开证行肯定负有第一性的付款责任；而银行保函的担保行未必负有第一性的付款责任。
4.跟单信用证的支付一般须付对价（转让汇票及/或提交正本货运单据）；而银行保函的支付却未必要付对价（有时只须提交书面索赔函或副本货运单据等）。
5.跟单信用证有非已付信用证，其交单到期地点可以是议付行/代付行/保兑行所在地；而银行保函只能由担保行受理索偿/索赔，其索偿/索赔到期地点只能是担保行所在地。
6.跟单信用证的支付在正常情况下是必然发生的；而银行保函的支付大多具有或然性。
7.跟单信用证的开证行常以要求申请人交付开证押金的办法来规避自身风险；而银行保函的担保行却多以要求委托人提供反担保的办法来规避自身风险。
8.跟单信用证有可转让信用证，其受益人权益可以转让；而银行保函的受益人权益一概不可转让。
9.跟单信用证业务一概遵循国际公认的《跟单信用证统一惯例》；而银行保函业务至今尚无能够得到国际公认的统一规则，它既可以遵循国际商会的《见索即付保函统一规则》或《合约保函统一规则》，又可以遵循担保行所在地的相关法规。

1）交易对手的资信情况；
2）货物的销路情况；
3）贸易条件的性质；
4）运输单据的性质；
5）其他因素。

可分为1）独立性保函；2）从属性保函。

1）买方承担了较大的风险；
2）资金负担较平衡且买卖双方都有较多基于交易融资手段；
3）手续繁，费用高。