通过基因工程和细胞工程改善食品原料农产品的品质和提高产量；
利用基因工程、发酵工程生产用于农产品保鲜的抗氧化剂、防腐剂等；
通过基因工程、发酵工程、酶工程、蛋白质工程和分子进化工程使食品加工工艺高效化、提高食品的附加值、提高农产品的利用率，提高食品的保健功能；
利用基因工程、酶工程和发酵工程减少食品的损失、提高食品质量管理的效率和保证食品质量和安全性；
通过发酵工程和酶工程处理废弃物，提高资源的利用率、并减少环境污染。

复制型载体又称穿梭载体：能在两种不同的生物体内复制和往来穿梭的载体.

（一）能独立自主的复制
（二）能便利的加以检测
（三）都能容易进入宿主细胞中去，也易从宿主细胞中分离纯化出来。