①利用基因工程改造食品微生物，如将α-乙酰乳酸脱羧酶基因克隆到酵母中进行表达，可降低啤酒双乙酰含量而改善啤酒风味；
②利用基因工程改善食品原料的品质，如改善乳牛的产奶量；提高植物性食品氨基酸含量；
③利用基因工程改进食品生产工艺，如采用基因工程改良小麦种子贮藏蛋白的烘烤特性；降低大麦中的醇溶蛋白含量，改良啤酒的加工工艺；
④利用基因工程生产食品添加剂及功能性食品，生产黄原胶，应用于生产保健食品的有效成分。