在近代自然科学产生时期，首先需要把自然界分解开来加以研究，考察各种自然过程的区别，这是科学研究必由之路，因此难免会撇开和忽略事物之间的总的联系；人们在认识事物时，开始总是先要注意这种事物是什么和有多少，难免忽略事物的产生、发展和转化过程；自然科学的发展中，首先是以机械运动形式为对象的力学达到完善的程度，其他自然科学还处在积累资料的阶段，因此，也就难免用力学的尺度衡量一切，用力学的规律解释一切。科学发展的一定的历史阶段，形成了唯物主义自然观的一定的历史形态。
进步意义和局限性：应该说这种形而上学的机械唯物主义自然观在当时是有进步作用的。由于它把自然界中起作用的原因都归结为自然界本身的规律的作用，有利于促使科学家去探索自然界的规律。尽管行而上学的思维方式忽视理论思维的作用，忽视事物之间的联系和发展，但它能刺激人们运用分析、解剖的方式，从观察和实验中取得更多的经验材料，这对科学的发展来说也是必要的。但同时又必须认识，由于它只看到了一个个事物，忘掉它们相互的联系，看到了它们的存在，忘了它们的产生和消失；看到了它们的静止，忘了它们的运动，只见树木，不见森林，因而又有着严重的缺陷。这种形而上学的自然观，在对自然界整体的看法上又似乎低于古代。