芽孢，又称内生孢子，是某些细菌生长到一定时期，在细胞内形成的一个圆形、椭圆形或圆柱形的、抗逆性很强的休眠体。形成过程：十分复杂，根据电子显微镜观察，可分为以下阶段：束状染色质形成（或轴丝形成）；细胞膜内陷、隔膜形成；前芽孢形成；皮层形成；芽孢衣形成；芽孢成熟；芽孢囊裂解，芽孢释放。