GIS的研究对象是地理实体，即指自然界现象和社会经济事件中不能再分割的单元。地理实体类别及实体内容的确定是从具体需要出发的，例如，在全国地图上由于比例尺很小，福州就是一个点，这个点不能再分割，可以把福州定为一个空间实体，而在大比例尺的福州市地图上，福州的许多房屋，街道都要表达出来，所以福州必须再分割，不能作为一个空间实体，应将房屋，街道等作为研究的地理实体，由此可见，GIS中的地理实体是一个概括，复杂，相对的概念。
地理实体以什么形式存储和处理反映了实体的三个特征。
属性特征：对空间实体的属性定义和说明信息。
空间特征：对空间实体的分布位置、几何特征和空间关系的定义。
时间特征：空间实体的时间尺度

与其它信息系统相比，GIS空间分析作为核心功能是比较独特的。