来自净化系统的CO₂进入塔釜，控制塔釜的温度使CO₂气化并上升到精馏塔。气态的CO₂与塔顶回流的液态CO₂逆流接触发生热量、质量传递。气相的CO₂浓度沿塔高向上逐渐提高并从塔顶进入冷凝器冷凝成液体后进入回流罐，通过回流泵把一部分液体CO₂送回精馏塔作为回流液，一部分作为产品送到储存系统。液相的重组分浓度沿塔高向下逐渐提高、CO₂浓度逐渐降低，重组分进入塔釜并在塔釜积累（CO₂中的重组分是微量的，可能看不到塔釜的液位上涨）、排放；更低沸点的组分（如氢气、氮气、甲烷等）在冷凝器不能冷凝，以不凝气的形式从冷凝器放空。沸点与CO₂相接近的组分不能得到分离。