该责令限改通知书不正确。根据《征管法》第十五条规定：企业及企业在外地设立的分支机构和从事生产、经营的场所，个体工商户和从事生产、经营的事业单位（以下统称从事生产、经营的纳税人）自领取营业执照之日起三十日内，持有关证件，向税务机关申报办理税务登记，税务机关审核后发给税务登记证件的规定。好再来服装店自2005年2月20日领取营业执照到2005年3月13日还不到30日，尚未违反上述规定，因此，税务所对其作出责令限期改正书的处理是错误的。

未做消费税税种认定。

（1）对该公司需要进行增值税、所得税税种认定。
（2）该公司增值税适用税率为13%。

增值税、消费税。

（1）未按照规定2人以上进行实地调查。该案中只有税收管理员陈某1人到企业实地调查。
（2）税收管理员未与有关人员进行约谈。

不全面。未调查该厂有无偷税行为或虚开增值税专用发票行为以及有无连续3个月未申报或者连续6个月异常的情况。

延长纳税辅导期或者取消其一般纳税人资格。