政府在水市场引导方面的主要职责是：引导和培育水交易市场、建立交易规则、水价形成机制和各类要素市场的运作管理机制等，使市场在资源配置中逐步发挥基础作用。要在水资源管理中引入市场机制，一般作法是：
①推行水票制、落实用水指标。张掖的做法是：水管单位科学预测来水、用水情况、编制各灌溉轮次配水计划并下达各用水协会，用水户以小组为单位根据所配水量到水管单位购买水票，水管单位凭票供水。实践证明，这种作法已显示出利用水票促进水费收缴、进行水量交易、提高用水效益的作用。
②制定交易规则、规范交易行为。如张掖市出台了水权交易指导意见，各试点灌区制定出台了水权交易管理规则、明确了管理机构与职责、水市场的管理与监督。