孕妇感染了病原微生物可经垂直传播感染胎儿而造成先天性畸形，常见的病原微生物有：
（1）梅毒螺旋体。可通过胎盘进入血流，并扩散至肝、脾、肾上腺等内脏大量繁殖，引起胎儿全身性感染，出生后这样先天性梅毒的婴儿呈现锯齿形牙，间质性角膜炎，先天性耳聋等症状。
（2）风疹病毒。孕妇在孕期4个月内感染风疹病毒可经胎盘引起垂直传播，导致胎儿先天性畸形或先天性风疹综合征，表现为先天性心脏病、耳聋、失明及智力低下等。
（3）单纯疱疹病毒。妊娠妇女因单纯疱疹病毒原发感染或潜伏感染的病毒被激活，病毒可经胎盘感染胎儿影响胚胎细胞的有丝分裂，引起胎儿畸形及智力低下。
（4）巨细胞病毒。病毒通过胎盘感染胎儿，引起造血系统、中枢神经系统损伤，出现小脑畸形，视神经萎缩等。
（5）人类免疫缺陷病毒。妊娠妇女可经胎盘将病毒传给胎儿，引起流产、死胎、胎儿畸形等，亦可经产道将病毒传给新生儿，还可经乳汁将病毒传给婴儿，使其机体CD4细胞受破坏而导致免疫功能低下或缺陷最后易导致机会病原菌感染，甚至发生癌变而死亡。
（6）人乳头瘤病毒。孕妇感染此病毒时，生殖器部位可出现尖锐湿疣，分娩时可经产道将病毒传给新生儿。其表现主要是受病毒感染部位可呈现乳头状瘤病变，甚至可发生癌变，常见有宫颈癌、肛门癌、口腔癌等。