1）用现代科学技术方法对传统药物的效能评价，使相关产品的质量得到保障，并推进质量的标准化和生物活性的“指纹”化。
2）进行生物源动物、植物、矿物等化学成分的深入研究，探讨其生物活性的差异，开发新的药用原料，使资源可持续利用。
3）依据研究者的经验和药物生物活性特征，寻找创新药物研究的备选化合物或先导物。
4）以天然药物化合物效能为出发点，探讨生物活性作用的靶点，建立新的天然药物筛选模型。
5）进一步探讨天然药物对预防及治疗疾病的生物化学机制。
6）寻找天然药物活性成分的提取、分离、纯化方法。
7）依据天然化合物的亲缘性和生物合成途径，结合模拟生物酶催化机制进行仿生物药合成路线设计。
8）根据化学物种的进化特征，从分子水平探讨生物物种进化趋势。
9）研究天然药物在有机体的分布、吸收、代谢等生物有效性及毒性，设计合成创新型药物。
10）充分利用天然药物手性化合物的资源，开展手性药物的研究。