难治性癫痫的主要病理改变为：
①海马硬化：具有一定的代表性，肉眼观察表现为海马体积的萎缩、坚硬，双侧海马硬化病变多呈现不对称性；镜下典型表现是神经元脱失和胶质细胞增生，且神经元的脱失在癫痫易损区更为明显，比如CA1区、CA3区和门区。
②苔藓纤维出芽：是海马硬化患者另一重要的病理表现。
③齿状回结构的异常。最常见的是颗粒细胞弥散增宽。
④海马门区发现异形神经元，伴有细胞骨架结构的异常。