肉眼：病变萎缩的细胞、组织和器官体积减小，重量减轻，色泽变深。
光镜下：实质萎缩：细胞体积缩小、数目减少，形状基本不变，功能代谢降低；间质反应性增生。
电镜下：心肌细胞和肝细胞等萎缩细胞内细胞器数目减少，胞质可出现褐脂素颗粒。褐脂素颗粒是细胞内未被彻底消化的富含磷脂的膜包被的细胞器残体。