①以原发灶不明颈部转移癌的部位寻找原发灶具有一定规律性。一般上颈部的淋巴结转移，原发灶多见于鼻咽、口腔、扁桃体、口咽以及头面部的肿瘤；淋巴结为腺癌转移者多来源于腮腺或甲状腺；下颈部淋巴结转移，原发灶多见于喉、甲状腺或颈段食管的肿瘤；单纯锁骨上区淋巴结转移，其原发灶则多见于胸、腹、盆部来源的肿瘤。
②对于颈部出现肿块的患者，不应首先切除取活检。应以鼻咽间接镜或电子内镜先检查鼻咽、喉部，往往可以发现原发灶的部位；继而可做头颈部CT 或MRI 增强扫描，必要时可做PET-CT 检查有利于找出隐匿性的微小原发灶。
③当患者经上述检查后未能确诊原发灶的转移淋巴结，则应该首先选用细针吸取活检术。应尽量避免粗针活检或切开活检，因为这可能影响或改变随后的治疗措施。当针吸活检证实是鳞状细胞癌、腺癌或间变上皮癌且原发灶不明时，需要行更多其他检查。
④对于组织学为鳞状细胞或未分化肿瘤来说，可行HPV-16和EB 病毒血清学的检测。同时应行鼻咽喉内镜检查、胸部摄片和增强CT 或增强MRI。 PET-CT 检查应该仅在以上检查没有发现原发灶的情况下施行。
⑤当影像学检查和完整的门诊检查（包括鼻咽、口咽、喉以及下咽等，还要注意皮肤）都没有发现原发病灶，这时候才能诊断为：原发灶不明颈部转移癌。