百日咳的主要病机是痰火交阻，肺气上逆。其诊断要点为未接种过百日咳疫苗，有百日咳接触史；有阵发性痉挛性咳嗽，咳嗽末有鸡鸣样吸气性回声，日轻夜重；面目浮肿，目睛出血，舌系带溃疡。初咳期末及痉咳期白细胞总数升高，可达（20～40）×10⁹／L，淋巴细胞升高，可60％～80％；用咳碟法或鼻咽拭子法作细菌培养，有百日咳杆菌生长；鼻咽拭子涂片作直接萤光抗体染色阳性；血清酶联免疫吸附试验检查PT、FHA特异性抗体增高。
婴幼儿年龄愈小，脏腑愈娇弱，病情愈易于传变。如：因其肺常不足、神气怯弱，易致肺气郁闭、邪陷心肝等。因此，患儿年龄愈小病情愈重。
百日咳与支气管异物均可有阵发性痉挛性咳嗽。百日咳者未接种过百日咳疫苗，有百日咳接触史：阵发性痉挛性咳嗽，咳嗽末有鸡鸣样吸气性回声，日轻夜重：面目浮肿，目睛出血，舌系带溃疡。用咳碟法或鼻咽拭子法作细菌培养，有百日咳杆菌生长；鼻咽拭子涂片作直接萤光抗体染色阳性；血清酶联免疫吸附试验检查PT、FHA特异性抗体增高。支气管异物者有异物吸入史，虽可有突发性痉挛性咳嗽，但缺乏其他百日咳症状，起病初白细胞计数不高，x线检查可协助诊断。

四者鉴别见表13—3。