可按病因或发病部位分类。一般教科书中有时将运动疾病分为创伤与骨疾病两大类。创伤又分为骨折、脱位及软组织损伤等。骨病则按病因或解剖部分分类。
（1）按病因分类
可分为：
①先天性畸形，由基因异常和（或）发育中的环境因素所致。
②创伤，由急性暴力引起（如骨折、脱位与软组织损伤）或慢性劳损引起，如慢性腰肌劳损。
③感染，如化脓性骨髓炎、关节炎、骨关节结核等。
④非特异性炎症，如类风湿性关节炎等。
⑤代谢性疾患，如骨软化症、痛风等。
⑥内分泌疾病，如甲状旁腺功能亢进引起的囊性骨炎、绝经期骨质疏松症等。
⑦退行性变，如骨性关节病。
⑧肿瘤，以骨、软骨、滑膜肿瘤较多见，而肌肉韧带肿瘤较少见。
⑨神经系统疾病引起的运动系统疾病，脊髓灰质炎大脑瘫后遗的肢体畸形及功能障碍。
（2）按病变部位分类
分为骨骼疾病、关节疾病、肌肉（包括肌腱及其他软组织）疾病等。