隋文帝继续沿着魏晋南北朝时期各政权对国家行政管理体制的调整方向进行彻底变革，其内容主要有两点：
（1）确立三公官不再兼任政府事务的原则。从东汉以来，三公官职务虽然已经荣誉化，但是，三公位居一品，品级极高，而且历史上作为中枢首脑的地位又有着巨大的惯性。比如，三国时期的曹操就是以丞相职称操纵朝政。隋文帝杨坚在北周时，也是大司马大将军。兼丞相的身份辅政代国的。所以隋文帝正式规定三公均不参加政府机构的活动，只作为奖赏有功之臣的最高荣誉职衔，而且，尽量不以公官授人，这就最终从体制上根除了旧体制的残余，为新的中枢体制的良好运转提供了保障。
（2）确定了三省之间的分权方式。魏晋以来，三省体制逐步成长，逐渐形成尚书掌行政、中书省掌诏令，门下省掌封驳的运行程序。但是由于传统三公制的影响，一些权臣往往改变这种分权，身兼数职，如东晋王导为司徒执政，还身兼侍中、录尚书事、领中书监等要职。而且，三省的分工在制度上也未固定，造成三省之间决策地位的游移，于是，隋文帝将这种分工确定下来，并将三省长官均定为三品，列为宰相，又确定尚书省总署为“政本之地”。以上措施将魏晋南北朝时期试行达300年的新体制加以定型，奠定了隋唐中央行政体制的基本构架。