mtDNA突变率远高于nDNA主要是因为：
1）mtDNA中基因排列非常紧密，任何mtDNA的突变都可能影响到其基因组内的某一重要功能区域；
2）mtDNA为裸露的分子缺乏组蛋白保护；
3）mtDNA直接暴露于呼吸链代谢产生的超氧离子和电子传递产生的羟自由基中，极易受氧化损伤；
4）mtDNA复制频率高，且复制时不对称，长时间处于单链状态，易发生脱氨基作用