⑴对调出地区环境影响：
①调出地区在枯水系列年，河流径流不足时，调水将影响调出地区的水资源调度使用，可能会制约调出区经济的发展。在枯水季节更可能造成紧邻调出口的下游地区灌溉、工业与生活用水的困难。
②调出地区河流水量减少，改变了原有河床的冲淤平衡关系，可能使河床摆动，河床淤积加剧；流量减小使河流稀释净化能力降低，加重了河流污染程度；另外也会影响河流对地下水的补给关系。
③若调水过多便会减少河流注入海湾的水量，使海洋动力作用相对增强，淡水与海水分界线向内陆转移，影响河口区地下水水质及河口稳定。
⑵对调入地区环境影响：
①改变了调入地区水文和径流状态，从而改变了水质、水温及泥沙输送条件。
②改变了调入地区地下水补给条件，引起地下水位升高。若调水灌溉的排水系统处理不当，会造成土地盐碱化、沼泽化。
③改变调入地区水生和陆生植物的生态环境、栖息条件，相应动植物的种群、数量会发生一定的变化；生态环境的改变也会影响调入区土地的利用。
④如调水时不注意对水质的控制，可能造成调入地区介水疾病的传染，影响人们健康。
⑶调水工程沿途地区环境影响：跨流域调水往往输送很长距离，有的长达上千千米。一方面由于输运工程跨越众多河流需要修建大量交叉建筑物，对跨越河流引起河床演变和防洪新问题。另一方面输运工程沿程经过一些调水工程范围内的工业和城市，可能引起对调水的污染。另外调水工程沿程跨越不同自然条件的地域，可能承受这些地域对所调水体的污染。有的调水工程将所经过的众多河流和湖泊作为部分引水线路，这些河流和湖泊事先有污物，或者其后被来自调水区域已污染的水体所污染，这样引起调水工程沿途各地对被调水体的污染。

水利水电工程环境影响评价工作包括两大部分：一是编制评价工作大纲，二是开展环境影响评价。