（1）改变领导体制。军委会取消了副委员长和常务委员，只设委员长一人，由陆诲空大元帅兼任。
（2）进一步扩大编制，抗战开始后，不仅平时直属国府的军事机构，如参谋本*部、训练总监部等移归军委会管辖，而且行政院的军政部。海军部也归其管辖。它是国民政府直属机关中最庞大的机关。
（3）进一步加重职权。军委会不仅是最高军事机关，而且是统辖全国军民作战的大本营。此外，通过军委会委员长侍从官室，还控制了从中央到地方的人事安排。