（1）提出了辨证论治范例。一是《伤寒论》以六经论伤寒，张仲景根据病邪侵害经络，脏腑的盛衰程度，病人正气的强弱，以及有无宿疾等条件，寻找发病的规律，并提出了自己的见解。二是《金匮要略》以脏腑论杂病：1.以脏腑辩证论述内科杂病为主。2.开后世脏腑辩证之先河。3.提出了一个比较完整的病因学说。
（2）对方剂学的贡献。1.被誉为“方书之祖”，基本概括了临床各科的常用药剂。2.提出了较谨慎的方剂组方原则。3.创制了多种方剂的剂型。4.记载了大量有效的方剂，如白虎汤，白头翁汤，酸枣仁汤。