五界系统：动物界、植物界、原生生物界（包括原生动物、单细胞藻类和粘菌等）、真菌界和原核生物界（包括细菌蓝细菌等）。六界系统：1949年Jahn提出包括后生动物界、后生植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界和病毒界；1977年我国学者王大耜提出动物界、植物界、原生生物界（包括原生动物、单细胞藻类和粘菌等）、真菌界和原核生物界（包括细菌蓝细菌等）、病毒界；1996年美国的P.H.Raven提出包括动物界、植物界、原生生物界、真菌界、真细菌界和古细菌界。三域学说：细菌域、古细菌域、真核生物域。

一个古老的学说，认为一切生命有机体能够从无生命的物质自然发生的。

研究微生物基因组的分子结构、信息含量及其编码的基因产物的科学。

重点研究微生物与寄主细胞相互关系的科学。

在分子水平上研究微生物生命活动规律的科学。

研究肉眼难以看清的称之为微生物的生命活动的科学，分离和培养这些微小生物需要特殊技术。