有的新生儿出生后有眼球震颤现象，医学上称之为先天性眼球震颤，也称先天性特发性眼球震颤，是眼源性眼球震颤的一种。此种眼球震颤不包括与某些先天性眼病并存的眼球震颤。发生先天性眼球震颤时，细小的眼球震颤常被忽略，可迟至出生后数周或数月才被发现，而明显的眼球震颤可持续数年，至成年后逐渐微弱。
先天性眼球震颤的发生机制不十分清楚，可能与脑干有关。脑干中枢与眼的“稳定注视”功能有联系，先天性眼球震颤被认为是眼球持续的细微运动被夸大的结果。这种眼球震颤在“稳定注视”时产生，是为了寻求最清晰的视觉影像而发生搜寻性运动造成的。某些先天性眼球震颤与由遗传因素有关。
先天性眼球震颤呈水平型，多无快相、慢相之分。亦有眼球震颤方向不同者，向右凝视时出现快相向右的眼球震颤，向左凝视时出现快相向左的眼球震颤。闭眼时或在暗室内时，先天性眼球震颤会消失。