(1)一般保存法：将细菌种于半固体培养基中，35℃培养18～24小时后封盖1cm厚的无菌石蜡油，置4℃保存。对链球菌、脑膜炎奈瑟菌等苛养菌在血平板上或血清培养基移种培养。
(2)冷冻干燥法：具有不改变菌种性状和保存时间长等特点。

不同来源的细菌称为该细菌的不同菌株。