将目的菌进行革兰染色，若为革兰阴性杆菌，再作氧化酶和葡萄糖氧化发酵(O/F)试验，如氧化酶阴性，葡萄糖为发酵型则可认为是肠杆菌科细菌。进而根据葡萄糖酸盐和苯丙氨酸脱氨酶试验将肠杆菌科细菌分为三大类，再根据细菌在选择性培养基上的颜色和形态、克氏双糖培养基上的反应，动力、吲哚、脲酶试验(MIU)，IMViC试验结果，综合分析鉴定到种。在肠杆菌科细菌中，EPEC、志贺菌、沙门菌除生化反应鉴定符合外，还须进行血清学试验将其鉴定到群、型。例如某菌，在麦康凯(MAC)平板和SS平板上生长为红色菌落，血平板上为灰色湿润中等偏大的菌落，革兰染色阴性，KIA上：斜面与底层均产酸产气，H2S(-)，MIU上为(++-)，IMViC为(++--)，通过以上生化反应可鉴定为大肠埃希菌。此菌来源于8个月龄的婴儿腹泻粪便，故将MAC上红色菌落与EPEC抗血清作凝集试验，结果与EPEC多价抗血清凝集阳性，再做H抗原测定，鉴定结果为EPECO119:H6，此时可发出最终鉴定报告。

白喉棒状杆菌在亚碲酸盐血琼脂上能吸收亚碲酸盐，并使其还原为元素碲，使菌落变黑。

根据菌体及鞭毛抗原的不同，可分为4个血清型，1、3、4型又分为若于亚型。