在非发酵菌的鉴定中，细菌是否具有鞭毛及鞭毛的特点有重要的诊断意义。由于非发酵菌大部分为专性需氧菌，在半固体培养基上观察动力不明显，因细菌在琼脂表面生长，底层穿刺生长不良或不生长，故观察非发酵菌的动力以30℃或室温12～24小时培养物悬滴法为准。有时需借助鞭毛染色予以鉴定。

弯曲菌属有耐热(O)抗原、不耐热抗原和鞭毛(H)抗原。

在罗氏培养基生长的结核分枝杆菌的菌落呈干燥颗粒状，不透明，乳白色或米黄色，表面呈皱纹状，形似菜花。

氧化酶试验是鉴定非发酵菌的重要试验，非发酵菌中除不动杆菌及个别假单胞菌外，氧化酶试验均为阳性。