牙石的致病作用主要是由于它表面常形成末钙化的菌斑，可导致牙龈炎症，加之牙石坚硬粗糙，对牙龈有机械刺激。牙石的多孔结构也容易吸附大量的细菌毒素，还妨碍口腔卫生措施的实施，因此牙石也是牙龈出血、牙周袋加深、牙槽骨吸收、牙周病发展的一个重要致病因素。

目前认为局限型青少年牙周炎的可疑致病菌为：伴放线放线杆菌。

目前认为成人牙周炎的可疑致病菌有：牙龈卟啉单胞菌、中间普氏菌、福赛类杆菌、直肠弯曲杆菌、核梭杆菌。