防治策略是选用抗病品种，种植无病种薯，消灭中心病株，结合病情预报全面喷药保护。具体防治方法如下：
1.选用抗病品种
2.建立无病留种地，选用无病种薯严格选用无病种薯对晚疫病起着重要作用。建立无病种薯田，无病留种田应与大田相距2.5km以上，以减少病原菌传播侵染的机会，并严格实施各种防治措施。在收获时应进行严格挑选，选取表面光滑、无病斑和无损伤的薯块留种用，晾晒数日后单收、单藏等。在播种催芽和切块时还应仔细检查，彻底清除遗漏的病薯，剔除的病薯要集中处理。
3.加强栽培管理选择高燥、沙性较强的或排水好的地块种植马铃薯。适时早播，不宜过密。合理使用氮肥，增施钾肥，保持植株健壮，增强植株的抗病力。合理灌溉，结薯后增加培土成高垄，减少薯块受侵染。及时清理中心病株或栽除病叶，及时深埋或烧毁。
4.药剂防治发现中心病株后立即喷药，尤其是在中心病株的附近。防治晚疫病有效药剂有：47%加瑞农、72%克露等。为防止抗药性的产生，建议几种药剂轮换使用，或将内吸性和保护性制剂混合使用。