(1)AFP原发性肝癌的普查指标，80%肝癌AFP升高，大约一半的肝癌可测到高浓度的AFP。灵敏的AFP检测结合超声常常能发现早期肝癌。AFP浓度和肝癌大小有关，还用于肝癌的治疗监测和预后判断。AFP和丙氨酸氨基转移酶(ALT)联合测定可用以鉴别良性肝脏疾病，如AFP超过500ng/ml，ALT基本正常，高度提示肝癌。AFP还用于肝癌的治疗监测和预后判断，AFP＞500ng/mL，胆红素＞2mg/L提示病人存活期很短；手术后AFP＞200ng/mL提示肝癌组织未完全切除或有转移。
(2)γ-GTⅡ诊断肝癌的阳性率达90%，但特异性不高，临床上γ-GTⅡ多用于AFP阴性肝癌的辅助诊断。
(3)肝ALP(ALPl)诊断肝癌的阳性率较高，升高最常见于原发性和继发性肝癌。
(4)TPA、TPS主要用于鉴别诊断胆管癌(TPA升高)和肝细胞癌(TPA不升高)。
(5)唾液酸和唾液酸酰基转移酶、铁蛋白广谱肿瘤标志物，常和其他标志联合应用提高诊断的敏感性和特异性。