酶是生物体活细胞产生的具有特殊催化功能的一类蛋白质，也被称为生物催化剂（biological catalyst）。酶具有一般催化剂的特性，即在一定条件下仅能影响化学反应速率，而不改变化学反应的平衡点，并在反应前后数量和性质不发生变化。
优点：①酶催化反应一般是在常温、常压、中性pH范围等条件下进行的，因此效率较高且节省能量；②由于酶催化反应的专一性，因此无（或很少）副产物生成，有利于分离和提纯；另外，利用酶的立体异构转移性，即只与某一种异构体或某一种构象底物发生作用，这是一般化学催化剂无法比拟的；③与微生物发酵法相比，其反应物简单.反应最适条件易于确定；④利用酶的专一性，可高效率分析天然物质和生物体成分，且不必对检体进行分离处理。
缺点：①由于在较温和的条件下进行反应，所以易发生杂菌污染；②酶的价格较高，精制过程工作量大，有必要开发低成本的精制技术；⑦仅限于一步或二步简单的反应，与微生物发酵相比，在经济上尚不理想；④从目前看，只能作用于限定的化合物。当然随着酶工程的不断发展，其适用的底物范围将不断扩大；⑤由于酶是蛋白质，所以其催化作用条件有一定限制，特别是当催化体系中含有抑制剂（或失活剂）时，将大大减弱酶的催化活力。另外，采用固定化技术，虽然有助于增加酶的稳定性，但酶终究还会失活。当底物为高分子化合物时，固定化酶并非一定是优良的生物催化剂。