（1）溶酶体病：溶酶体内的水解酶有先天性缺陷，损害神经细胞功能。
（2）过氧化物体病：细胞内过氧化物体的数目减少或其中酶的活性缺乏。
（3）线粒体脑肌病：线粒体呼吸链的酶缺陷引起的遗传病。
（4）氨基酸、有机酸、尿素代谢异常等。
（5）糖代谢障碍、脂代谢障碍、粘多糖代谢障碍；
（6）嘌呤代谢病：高尿酸血症等。
（6）金属代谢病：肝豆状核变性等。