①粪便检查：患者用生理盐水直接涂片镜检含红细胞的滋养体；带虫者用碘液直接涂片法检查包囊，必要时用硫酸锌离心漂浮法检查包囊，但无法区别于迪帕斯内阿米巴；
②乙状结肠镜检查：观察肠壁溃疡，直接取材检查大滋养体；
③穿刺液及痰液检查：阿米巴肝、肺脓肿的患者，取脓液或咳出的痰液涂片镜检大滋养体，但检出率较低；
④免疫学检查：主要用于流行病学调查，以间接血凝试验及间接荧光抗体法应用较多。用免疫学方法诊断阿米巴肝脓肿，阳性率很高；
⑤其他检查：可对同工酶谱进行分析，排除迪斯帕内阿米巴，或利用PCR 检测溶组织内阿米巴特异性基因，利用X线、超声波检查阿米巴肺、肝脓肿患者。