学校预防性卫生监督按以下监督程序进行：
（1）学校根据教育工作的需要，向设计单位提出新改扩建工程建设项目要求；设计单位进行设计，提交建设项目设计图纸和设计卫生说明。
（2）学校卫生监督机构收到学校提出的建设项目设计审核申请书后，按实际需要，有的会同有关部门和科室（如食品卫生建设项目应会同食品卫生科）共同完成设计审核工作；有的（如教学和辅助设施项目）独立进行审核。
（3）按国家有关法规和卫生标准对建设项目进行图纸和现场审核，合格者签发《建设项目审查认可书》并盖章；对不符合卫生要求的项目提出审核和修改意见。
（4）学校若取得认可书，可通知施工单位按审核后的设计方案施工；若不能取得认可书，应按审核意见认真修改，重新进行复审，直至符合卫生要求为止。
（5）学校卫生监督机构根据学校提出的竣工验收申请，按实际需要，或单独或联合相关科室，参加对该建设项目的竣工验收。对验收合格的项目工程，签发《建设项目竣工卫生验收认可书》并盖章。该建设项目方可正式投入使用。
（6）学校卫生监督机构整理对该项目的预防性卫生监督相关资料并存档。

学校突发事件主要是与卫生有关，包括传染病的爆发疫情、食品污染与中毒、饮水与环境严重污染、服用药物后发生的集体不良反应等。

预防性卫生监督是依据国家有关的法律法规条例、规范和卫生标准，对新改扩建的学校和少年儿童的文化体育活动场所进行卫生审查。