促进重组。增加基因组的复杂性。含有可读框。基因组中外显子和内含子是相对的，有些内含子具有编码序列，能产生蛋白质或功能RNA。含有部分剪接信号。产生核仁小RNA。内含子对基因表达有影响。
存在意义：有利于变异与进化，增加重组机率，提高进化率。

&X174噬菌体；重叠基因存在意义：提高基因利用率。