1、古典学派重视一般规律，李斯特等强调不同国家的特殊性，认为必须建立适合于落后的或正在兴起的国家的经济学，要研究各民族自己的发展道路。
2、古典学派把当时国际分工模式看成是永远不变的，李斯特等强调历史的发展，强调国际分工模式的可变性。
3、古典学派重视微观经济分析，李斯特等重视宏观考察，强调国民经济是一个有机的整体，并强调民族精神、国家组织、法律制度、教育等对国民经济发展的作用。
4、古典学派强调自由竞争，李斯特等强调国家干预，提倡在一定阶段实行保护贸易政策，鼓吹社会改良。
5、在方法论上，李斯特等反对古典学派的抽象、演绎的方法，而主张实证的历史主义方法。