免疫球蛋白同种异型的遗传，在重链或轻链的同一位置上氨基酸不相同的同种异型是由常染色体共显性基因遗传的。但基因的表达具有等位基因排斥现象。
虽然杂合子的两个等位基因同时表达，但任何一个免疫球蛋白分子只有一个同种异型。因为一个B细胞只能表达一种等位基因，称为等位基因排斥现象。