一是避免育性转换后同一株产生两类种子。如果光（温）敏核不育系在幼穗分化期遇上连续几天23.5℃以下的低温，可采用化学杀雄，达到防杂保纯的目的。
二是高标准培育“早、匀、齐”壮秧，使分蘖早、多、齐，移栽后早管理、早晒田，避免抽穗不齐造成自身混杂。
三是要适时收割，一般来说在母本齐穗25d，以达到固有的发芽率和容重。因此，在母本齐穗25d左右，要抢晴收割，使不育系植株的地上节长出的分蘖苗不能正常灌浆结实，避免自身混杂。

以恢复系和不育系播始历程有效积温累计的差数确定母本播期。播种当天不计。

以恢复系播后的叶龄确定不育系播期的方法叫叶差法。叶差比时差法更可靠些。

恢复系与不育系播种日期相差（隔）天数，常称为播种差期。调节父母本的播种差期有三种方法，简称三差法。

不育系与恢复系杂交以获得杂交种子的生产过程称之为杂交水稻制种。

保持系与不育系杂交获得不育系种子；恢复系和不育系杂交获得杂交种种子；保持系自交种仍是保持系；恢复系自交种仍是恢复系。