在鱼类中，作为支持躯体中轴的脊索为一系列脊椎骨构成的脊柱所代替，从而加强了支持身体、保护脊髓的机能。
鱼类的骨骼的组成：包括中轴骨骼和附肢骨骼。中轴骨骼包括头骨和脊柱，附肢骨骼包括带骨和鳍骨，带骨是指连接四肢骨与脊柱之间的骨骼。
头骨：包括脑颅（一般指包围脑、眼、耳和鼻等的骨骼的统称）和咽颅（指包围口和咽的骨骼的统称，如鱼的鳃骨，即鳃弓就属于咽颅骨骼的组成部分），鱼类头骨最为复杂，骨块数目最多，对头骨各骨块的名称一般不要求记住，可一般了解。
脊柱：无颈椎，脊椎骨和头骨相连，头不能转动。脊柱分化程度低，只分为躯椎和尾椎。每一躯椎由椎体（椎本体）、椎弓（髓弓，弓形，位于椎体背方两侧，中枢神经的脊髓从中通过，故名）、髓棘（棘突，由椎体背方左右两侧的椎弓在其相交处愈合而形成的刺形骨骼部分）、椎体横突（是椎本体两侧的横向突出部分）4部分组成，椎体横突与肋骨相关节；尾椎由椎体（椎本体）、椎弓（髓弓）、髓棘（棘突）、脉弓（弓形，位于椎体腹方两侧，是尾动脉和尾静脉的通道，故名）、脉棘（由椎体腹方左右两侧的脉弓在其相交处愈合而形成的刺形骨骼部分）5部分组成。尾椎不与肋骨相连。鱼类有肋骨，无胸骨。
椎体全为双凹型（是最原始类型）。在相邻两椎体间的空隙和椎体中央小管内尚留有残余的脊索。