原因
1、种胚尚未成熟：这种情况是指种子虽然已达到成熟阶段，脱离了母株，但是种胚并没有完全成熟，仍需要从胚乳中吸收养料，完成形态上的分化和生理上的成熟，这一过程称为种子的后熟，也称后熟休眠。
2、种被的障碍：主要表现在种皮的不透水性、种被的不透气性和种被的机械约束作用。
3、抑制物质的存在：有些植物的果皮、胚乳或胚部含有如氨、氰化氢、芳香油类、植物碱及有机酸类等物质，这类物质有抑制发芽的作用。
4、不适宜条件的影响：是指原能发芽的种子，放在不适宜萌发的环境中，使它重新陷入休眠状态，这种现象叫再度休眠或二次休眠。
方法
（1）机械破损适用于有坚硬种皮的种子。可用沙子与种子摩擦、划伤种皮或者去除种皮等方法来促进萌发。
（2）清水漂洗播种前将种子浸泡在将种子埋在湿沙中置于1～10℃温度中，经1～3个月的低温处理就能有效地解除休眠。在层积处理期间种子中的抑制物质含量下降，而GA、和C、TK的含量增加。一般说来，适当延长低温处理时间，能促进萌发。
（3）温水处理某些种子（如棉花、小麦、黄瓜等）经日晒和用35～40℃温水处理，可促进萌发。
（4）化学处理
（5）生长调节剂处理多种植物生长物质能打破种子休眠，促进种子萌发。其中GA、效果最为显著。
（6）光照处理需光性种子种类很多，对照光的要求也很不一样。
（7）物理方法用X射线、超声波、高低频电流、电磁场处理种子，也有破除休眠的作用。