养殖业生态工程与传统养殖业是有区别的，其主要区别是：
1．基础理论上，养殖业生态工程不仅以畜、禽、鱼等的饲养、繁育等专业基础理论为依据，还要以生态学、生态经济学、系统科学与生态工程等的基础原理为指导。
2．内容上，养殖业生态工程涉及的领域比较广泛，除畜牧业之外，还要研究种植业、林果业、草业、渔业、农副产品加工业、农村能源、农村环保等多学科的综合应用技术，而传统养殖业则突出畜牧业这一学科的技术应用。
3．效益、目标上，传统养殖业偏重于单一经济目标的实现；而养殖业生态工程则考虑经济、生态、社会三大效益的综合及目标的并重实现，谋求技术的综合配套应用和生态、经济的相互统一。
4．资源利用上，养殖业生态工程强调自然资源的多重利用和合理配臵、能量的多层利用和有效转换；力求产出的成品与“废品”间通过合理利用与转化达到系统内无废物产出；把低值资源转为高值无残毒的成品，从而把增值提高到最高水平，把无效损失降低到最低水平。
5．布局上，养殖业生态工程把种植、养殖、加工等环节合理地设计在一个系统的不同空间内，不仅增加了生物种群和个体的数目，充分利用土地、水分、热量等资源，而且更利于保护生物多样性、生态平衡和环境的清洁。

原因影响结果，结果又影响原因。原因与结果通过信息流组成一个闭合的反馈系统，称之为因果反馈环。

是生物与生物之间、不同系统之间的合作共存、互惠互利关系。人类与自然界的共生是指人类社会与自然界之间的互利共存关系。