运用这条原则应当注意以下几个问题：
（1）怎样合理组合
要做到合理组合，首先要有一个整、分、合的观念。即把整体分解为要素，再对各个要素进行分析，根据要素的功能再按一定的方式重新组合。这个原则中的整体观点是大前提。不充分了解整体的全貌、系统的目标和运动或变化的规律，分析必然是混乱而盲目的。这里的分析是关键，没有分析的整体只是混沌的原始物，就不可能进行合理的组合、适当的组织，不可能按照科学规律进行最佳效益的综合协作或协同考虑，就构不成现代有序的系统。最后是在分析的基础上进行科学的组合。这样就可以使整体由原来的无序走向有序。有序的程度越高，整体的结构也越紧密，系统功能越佳。
例如，班干部的选择就应当有个整、分、合的思想观念。如果我们只根据学生个人的特长选干部，学习好的学生当学习委员，唱歌好的学生当文艺委员，体育好的学生当体育委员等等，不考虑这些学生的其他方面的能力和在班级中的作用，这样组成的班委会并不能成为班级的核心。应当首先将班级作为一个整体看待，从班级的特点、班级的目标、班级学生的现状等方面对班级进行分析，体育委员应当是在爱好体育的学生中有威信、有组织能力的人，他的体育成绩不一定是拔尖的。其他干部亦是如此。这些有威信、能带头、能组织的学生当班干部，才能使班委成为班级的核心。
（2）合理是相对的
合理组合的目的是使整体优化。但任何优化都是条件下的优化，条件变了，在先前情况下视为优化的结果，也可能并非是最优的。50年代院系调整、课程调整时，视为最佳的专业设置、课程设置是适应了当时科学发展细分阶段的要求。在学科高度综合交叉发展的今天，它不再是最优的，所以要进行专业设置和课程结构的改革，以求现在条件下的合理组合。随着时间、地点、条件的变化，整体结构的合理性也会发生变化。
（3）合理组合的择优
合理组合应当找出几种可以替代的组合方式进行择优。在确定组织的分工协作时，也最好有几套方案以备比较选择，以使整体功能最优化。没有比较选择，就没有最优。
（4）组合的有序性和聚合性
有序是一个系统稳定运行的重要标志。序具有按次弟区分、排列的含义，它可以表现为要素之间的层次和比例关系。因此，序包括了时间意义上和空间意义上的秩序，反映着事物存在的客观条件。无序即混乱，也反映了系统内部不合理的组合。如行政组织内部人员结构的无序，没有了清晰的上下级的关系，行政指令也就无法有序上下递达，必然会出现组织行为上的混乱；再如工作无轻重缓急，眉毛胡子一把抓，人、财、物分配比例失调。所谓调整和理顺关系，实际上就是把不合理的组合变为合理的组合，合理的组合是有序的。
聚合性是指一个合理的组合应当具有凝聚力，它能把分散的、无组织的状态以及相互独立的要素联系在一起形成一个有机整体。如果组织内部存有排它性、异已的力量，而组织自身又没有克服这种力量的能力，这样的组织只能是一个无战斗力的涣散的组织。因此，我们要求组织的聚合性大于排它性，这才可能成为一个合理的组合。而系统的有序性正是系统聚合性的前提和保证。所以要想使组织具有聚合力，首先应当保证组织的有序性。当然，在现实工作中，绝对无矛盾、无冲突的环境是没有的，但我们应当尽可能的使组织有序，以提高组织的聚合性，而不能人为地使组织无序，降低组织的聚合力。现实管理工作中的应人设岗、多头领导、因人设课、任人唯亲、拉帮结派、领导的软弱无能，都会造成组织的无序而使组织涣散。

目标一致原则、统一指挥原则、职、权、才相适应原则、协调一致原则、信息沟通原则、非常例原则。