棉籽和幼芽受害，变褐腐烂；棉苗受害，幼茎基部初呈红褐色斑，渐呈红褐色凹陷的梭形病斑，病重时斑包围茎基部或根部，呈黑褐色湿腐状，棉苗枯萎而死。子叶受害，叶缘产生褐色半圆形病斑，病斑边缘紫红色。

棉铃虫发生在棉花生长的中后期，幼虫主要为害棉花的花、蕾、铃等繁殖器官，引起脱落和烂铃，因而危害严重。