近交系动物发生遗传变化的主要原因是环境发生了变化。

近交系小鼠的近交系数应大于90％。

生化标记基因检测：基因的改变将导致其基因产物如同工酶和蛋白质的变化，利用同工酶和异构蛋白的多态性变化探测实验动物基因变异的方法称之为生化标记基因检测。

遗传监测：通过形态学、免疫学和生物化学方法测定动物品系的遗传组成是否发生变化。

分离近交系：近交系的培育、繁殖过程中一个或几个位点的基因必须处于杂合状态的近交系。

同源导入近交系：通过杂交一互交（Cross－intercross）或回交（BA、ckcross）等方式将一个基因导入到近交系中，由此形成的一个新的近交系与原来的近交系只是在一个很小的染色体片段上的基因不同，称为同源导入近交系（同类近交系）。

同源突变近交系：两个近交系，除了一个指明位点等位基因不同外，其他遗传基因全部相同。称为同源突变近交系，简称同源突变系。

重组近交系：任意两个品系杂交后，再连续20代以上的兄妹交配，育成的近交系。

重组近交系：由两个不同近交系杂交后，F2代重新编组、互交，再连续20代以上的兄妹交配，育成的近交系。