孤独症的远期预后欠佳。约三分之二有明确社会适应不良。预后不良的因素有：女性，幼儿期重复刻板动作或异常行为突出，伴有自伤行为，操作性智商低，少年期仍有癫痫发作。5岁时语言的发育状况对预后影响很大，若此时仍然缺乏有意义语言，不能会话，则预后很差。良好的教育训练和治疗有助于改善预后。