感染过程：粪便排出的卵囊（新鲜卵囊，未孢子化卵囊），在适宜的温度和湿度条件下，约经1~2d发育成感染性卵囊（孢子化卵囊）。这种卵囊被鸡吃了以后，子孢子游离出来，钻入肠上皮细胞内发育成裂殖子、配子、合子。合子周围形成一层被膜，被排出体外。鸡球虫在肠上皮细胞内不断进行有性和无性繁殖，使上皮细胞受到严重破坏，遂引起发病。