(1)生物学原因在关于同性恋的研究中确实发现有少数患者内分泌异常或性染色体畸变。有的学者认为人体最初的胚胎发育具有双性的基础。这些原始双性结构的残余及异性性激素的残余可能是同性恋的生物学基础。但大多数性心理障碍目前尚未发现生物学方面的异常变化。
(2)心理因素心理因素可能是主要的因素。弗洛尹德认为性变态与其性心理发展过程中遇到挫折有关。有些父母出于自身的喜好和期待，有意无意地引导孩子向异性发展如将男孩打扮成女孩或将女孩打扮成男孩。自幼生长于异性的包围圈中容易导致儿童心理朝异性化发展。
(3)社会因素性心理障碍的产生与文化背景有一定的关系。