当从肌肉向肝脏转运1分子丙氨酸，相当于从肌肉带至肝脏1分子丙酮酸和1分子氨，这样既防止了肌肉中丙酮酸的积累又清除了氨。在肝脏，丙氨酸脱氨后，氨进入尿素合成途径被清出体外，丙酮酸进入糖异生途径合成葡萄糖，可再次回到肌肉被利用。这样得到一举两得的功效，所以说葡萄糖—丙氨酸循环是一种经济、有效的氨转运方式。

因为这样有利于将NH3严格控制在线粒体中，防止其扩散进入血液引起氨中毒。