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参考答案:

碱基替换模型包括,No.ofdifferences、p-distance、Jukes-Cantordistance、Tajima-Neidistance、Kimur2-parameterdistance、Tamura3-parameterdistance、Tamura-Neidistance
p-distance:表示有差异的核苷酸位点在序列中所占比例,将有差异的核苷酸位点数除已经比对的总位点数就可以得到
Jukes-Cantor:模型假设ATCG的替换速率是一致的,然后给出两个序列核苷酸替换数的最大似然估计
Kimura2-parameter:模型考虑到了转换很颠换队多重击中的影响,但假设整个序列中4钟核苷酸的频率是相同哈德在不同位点上的碱基替换频率是相同的

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